; ; ; POPC, OPLS AA, TIP3 water ; ; 2 ; | ; 7 1-4-3 11 ; \ | / ; 5-8-13-12-9 ; / | \ ; 6 15-16-14 10 ; | 1 1 1 1 1 1 1 1 ; 17-19-18 90 89 96 95 02 01 08 07 14 13 20 19 125 126 ; | \ / \ / \ / \ / \ / \ / \ / ; 20 21 87 88 94 100 106 112 118 124 130 ; \ / \ / \ / \ / \ / \ / \ / \ / \ / ; 23 80 81 84 85 91 97 103 109 115 121 127 ; / \ \ / ||/ \ / \ / \ 1/ 1\ 1/ 1\ 1/ 1\ 1/ 1\ / \ ; 24 22 79-82-83 86 93 92 99 98 05 04 11 10 17 16 23 22 129 128 ; \ / ; 27-28-29 34 35 40 41 46 47 52 53 58 64 65 70 71 76 77 56 59 ; / \ \ \ / \ / \ / \ / | \ / \ / \ / \ / ; 25 26 30-31-33 39 45 51 57 63 69 75 133 ; || \ / \ / \ / \ // \ / \ / \ / \ / \ ; 32 36 42 48 54 60 66 72 78 134 ; / \ / \ / \ | / \ / \ / \ / \ ; 37 38 43 44 50 49 55 62 61 68 67 74 73 132 131 ; [ moleculetype ] ; Name nrexcl POPC 3 ; [ atoms ] ; nr type resnr residu atom cgnr charge mass 1 HCN 1 POPC H1A 0 0.1484 1.0000 2 HCN 1 POPC H2A 0 0.1484 1.0000 3 HCN 1 POPC H3A 0 0.1484 1.0000 4 CN3 1 POPC CA 0 -0.2795 12.0000 5 HCN 1 POPC H1B 1 0.1484 1.0000 6 HCN 1 POPC H2B 1 0.1484 1.0000 7 HCN 1 POPC H3B 1 0.1484 1.0000 8 CN3 1 POPC CB 1 -0.2795 12.0000 9 HCN 1 POPC H1C 2 0.1484 1.0000 10 HCN 1 POPC H2C 2 0.1484 1.0000 11 HCN 1 POPC H3C 2 0.1484 1.0000 12 CN3 1 POPC CC 2 -0.2795 12.0000 13 N3c 1 POPC N3 3 0.3372 14.0000 14 opls_140 1 POPC H1D 4 0.1484 1.0000 15 opls_140 1 POPC H2D 4 0.1484 1.0000 16 opls_136 1 POPC CD 4 -0.1311 12.0000 ; 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CM CT CT from oplsaa.ff/ffbonded.itp 48 51 52 1 48 51 53 1 49 48 50 1 49 48 51 1 50 48 51 1 51 54 57 1 124.000 585.760 ; CM CM CT from oplsaa.ff/ffbonded.itp 51 54 55 1 117.000 292.880 ; CT CM HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 52 51 53 1 52 51 54 1 117.000 292.880 ; CT CM HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 53 51 54 1 109.500 292.880 ; CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 54 57 60 1 124.000 585.760 ; CM CM CT from oplsaa.ff/ffbonded.itp 54 57 58 1 55 54 57 1 57 60 63 1 111.100 527.184 ; CM CT CT from oplsaa.ff/ffbonded.itp 57 60 61 1 109.500 292.880 ; CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 57 60 62 1 109.500 292.880 ; CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 58 57 60 1 117.000 292.880 ; CT CM HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 60 63 66 1 60 63 64 1 60 63 65 1 61 60 62 1 61 60 63 1 62 60 63 1 63 66 69 1 63 66 67 1 63 66 68 1 64 63 65 1 64 63 66 1 65 63 66 1 66 69 72 1 66 69 70 1 66 69 71 1 67 66 68 1 67 66 69 1 68 66 69 1 69 72 75 1 69 72 73 1 69 72 74 1 70 69 71 1 70 69 72 1 71 69 72 1 72 75 76 1 72 75 77 1 72 75 78 1 73 72 74 1 73 72 75 1 74 72 75 1 76 75 77 1 76 75 78 1 77 75 78 1 ; 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75 78 131 1 75 78 132 1 75 78 133 1 131 78 132 1 131 78 133 1 132 78 133 1 78 133 134 1 78 133 56 1 78 133 59 1 56 133 59 1 56 133 134 1 59 133 134 1 [ dihedrals ] ; ai aj ak al funct phi0 cp mult ; 1 4 13 8 3 1 4 13 12 3 1 4 13 16 3 2 4 13 8 3 2 4 13 12 3 2 4 13 16 3 3 4 13 8 3 3 4 13 12 3 3 4 13 16 3 ; 5 8 13 4 3 5 8 13 12 3 5 8 13 16 3 6 8 13 4 3 6 8 13 12 3 6 8 13 16 3 7 8 13 4 3 7 8 13 12 3 7 8 13 16 3 ; 9 12 13 4 3 9 12 13 8 3 9 12 13 16 3 10 12 13 4 3 10 12 13 8 3 10 12 13 16 3 11 12 13 4 3 11 12 13 8 3 11 12 13 16 3 ; 4 13 16 14 3 4 13 16 15 3 4 13 16 19 3 8 13 16 14 3 8 13 16 15 3 8 13 16 19 3 12 13 16 14 3 12 13 16 15 3 12 13 16 19 3 ; 13 16 19 17 3 13 16 19 18 3 13 16 19 20 3 14 16 19 17 3 14 16 19 18 3 14 16 19 20 3 15 16 19 17 3 15 16 19 18 3 15 16 19 20 3 ; 16 19 20 23 3 17 19 20 23 3 18 19 20 23 3 ; 19 20 23 21 3 19 20 23 22 3 19 20 23 24 3 ; 20 23 24 27 3 21 23 24 27 3 22 23 24 27 3 ; 23 24 27 25 3 23 24 27 26 3 23 24 27 28 3 ; 24 27 28 29 3 24 27 28 30 3 24 27 28 79 3 25 27 28 29 3 25 27 28 30 3 25 27 28 79 3 26 27 28 29 3 26 27 28 30 3 26 27 28 79 3 ; ; ; 27 28 30 31 3 79 28 30 31 3 29 28 30 31 3 ; 28 30 31 32 3 28 30 31 33 3 ; 30 31 33 34 3 32 31 33 34 3 30 31 33 35 3 32 31 33 35 3 30 31 33 36 3 32 31 33 36 3 ; 31 33 36 37 3 31 33 36 38 3 31 33 36 39 3 34 33 36 37 3 34 33 36 38 3 34 33 36 39 3 35 33 36 37 3 35 33 36 38 3 35 33 36 39 3 ; 37 36 39 40 3 37 36 39 41 3 37 36 39 42 3 38 36 39 40 3 38 36 39 41 3 38 36 39 42 3 33 36 39 40 3 33 36 39 41 3 33 36 39 42 3 ; 36 39 42 43 3 36 39 42 44 3 36 39 42 45 3 40 39 42 43 3 40 39 42 44 3 40 39 42 45 3 41 39 42 43 3 41 39 42 44 3 41 39 42 45 3 ; 39 42 45 46 3 39 42 45 47 3 39 42 45 48 3 43 42 45 46 3 43 42 45 47 3 43 42 45 48 3 44 42 45 46 3 44 42 45 47 3 44 42 45 48 3 ; 42 45 48 49 3 42 45 48 50 3 42 45 48 51 3 46 45 48 49 3 46 45 48 50 3 46 45 48 51 3 47 45 48 49 3 47 45 48 50 3 47 45 48 51 3 ; 45 48 51 52 3 45 48 51 53 3 45 48 51 54 3 2.92880 -1.46440 0.20920 -1.67360 0.00000 0.00000 ; CM CT CT CT from oplsaa.ff/ffbonded.itp 49 48 51 52 3 49 48 51 53 3 49 48 51 54 3 0.76567 2.29701 0.00000 -3.06269 0.00000 0.00000 ; CM CT CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 50 48 51 52 3 50 48 51 53 3 50 48 51 54 3 0.76567 2.29701 0.00000 -3.06269 0.00000 0.00000 ; CM CT CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp ; 48 51 54 55 3 0.66525 1.99576 0.00000 -2.66102 0.00000 0.00000 ; HC CM CT HC (!) from oplsaa.ff/ffbonded.itp 48 51 54 57 3 0.52719 -6.39734 -1.69452 7.56467 0.00000 0.00000 ; CM CM CT CT from oplsaa.ff/ffbonded.itp 52 51 54 55 3 0.66525 1.99576 0.00000 -2.66102 0.00000 0.00000 ; HC CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 52 51 54 57 3 -0.77822 -2.33467 0.00000 3.11290 0.00000 0.00000 ; CM CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 53 51 54 55 3 0.66525 1.99576 0.00000 -2.66102 0.00000 0.00000 ; HC CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 53 51 54 57 3 -0.77822 -2.33467 0.00000 3.11290 0.00000 0.00000 ; CM CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp ; 51 54 57 58 3 51 54 57 60 3 55 54 57 58 3 55 54 57 60 3 51 54 57 60 2 0 45 ; 54 57 60 61 3 -0.77822 -2.33467 0.00000 3.11290 0.00000 0.00000 ; CM CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 54 57 60 62 3 -0.77822 -2.33467 0.00000 3.11290 0.00000 0.00000 ; CM CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 54 57 60 63 3 0.52719 -6.39734 -1.69452 7.56467 0.00000 0.00000 ; CM CM CT CT from oplsaa.ff/ffbonded.itp 58 57 60 61 3 0.66525 1.99576 0.00000 -2.66102 0.00000 0.00000 ; HC CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 58 57 60 62 3 0.66525 1.99576 0.00000 -2.66102 0.00000 0.00000 ; HC CM CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 58 57 60 63 3 0.66525 1.99576 0.00000 -2.66102 0.00000 0.00000 ; HC CM CT HC (!) from oplsaa.ff/ffbonded.itp ; 57 60 63 64 3 0.76567 2.29701 0.00000 -3.06269 0.00000 0.00000 ; CM CT CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 57 60 63 65 3 0.76567 2.29701 0.00000 -3.06269 0.00000 0.00000 ; CM CT CT HC from oplsaa.ff/ffbonded.itp 57 60 63 66 3 2.92880 -1.46440 0.20920 -1.67360 0.00000 0.00000 ; CM CT CT CT from oplsaa.ff/ffbonded.itp 61 60 63 64 3 61 60 63 65 3 61 60 63 66 3 62 60 63 64 3 62 60 63 65 3 62 60 63 66 3 ; 60 63 66 67 3 60 63 66 68 3 60 63 66 69 3 64 63 66 67 3 64 63 66 68 3 64 63 66 69 3 65 63 66 67 3 65 63 66 68 3 65 63 66 69 3 ; 63 66 69 70 3 63 66 69 71 3 63 66 69 72 3 67 66 69 70 3 67 66 69 71 3 67 66 69 72 3 68 66 69 70 3 68 66 69 71 3 68 66 69 72 3 ; 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